از نظر تغذیهای، مهمترین مکانیسم پروبیوتیکها در دستگاه گوارش آبزیان بهبود جذب غذا با تولید آنزیمهای خارج سلولی و تولید ویتامینها میباشد. تاثیر مهم دیگر پروبیوتیکها کاهش میزان وقوع و دوره بیماری، تقویت سیستم ایمنی و فعالیت های ضد میکروبی است. همچنین پروبیوتیکها با حذف رقابتی میکروارگانیسمهای مضر در حوضچههای پرورش موجب بهبود کیفیت آب و محیط زیست آبزیان میشوند.