پروبیوتیک‌ها بعد از مصرف و استقرار در دستگاه گوارش حیوان موجب بهبود عملکرد دستگاه گوارش میزبان شده و با اتصال به دیواره روده و ممانعت از تشکیل کلنی توسط میکروارگانیسم‌های بیماریزا به عنوان سدی در برابر پاتوژن‌ها عمل میکنند. علاوه بر این، پروبیوتیک‌ها ترکیباتی تولید میکنند که با مکانیسم‌های مختلف قادر به خنثی نمودن سموم تولید شده توسط عوامل بیماریزا در دستگاه گوارش شده و با مکانیسم اگریگاسیون و کواگریگاسیون عوامل بیماریزا را به خارج از بدن حیوان، دفع میکنند. میکروارگانیسم‌های پروبیوتیک با اتصال به دیواره روده علاوه بر ایجاد تعادل میکروبی در فلور روده با تحریک سیستم ایمنی و تأثیر بر حرکات دودی روده، فعالیت دستگاه گوارش و سیستم ایمنی را بهبود بخشیده و در پیشگیری و درمان بیماری‌هایی مانند کولیت، تأثیر قابل توجهی دارند.
